Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCND1Q9NSA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCND1Q9NSA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCND1Q9NSA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCND1Q9NSA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KCND1Q9NSA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCND1Q9NSA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCND1Q9NSA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCND1Q9NSA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCND1Q9NSA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCND1Q9NSA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCND1Q9NSA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms