Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASS4Q9NQ75 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASS4Q9NQ75 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CASS4Q9NQ75 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASS4Q9NQ75 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASS4Q9NQ75 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASS4Q9NQ75 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASS4Q9NQ75 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASS4Q9NQ75 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASS4Q9NQ75 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASS4Q9NQ75 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASS4Q9NQ75 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASS4Q9NQ75 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASS4Q9NQ75 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASS4Q9NQ75 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASS4Q9NQ75 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASS4Q9NQ75 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASS4Q9NQ75 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.6 ms