Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH12Q9NPG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH12Q9NPG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH12Q9NPG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH12Q9NPG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH12Q9NPG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDH12Q9NPG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDH12Q9NPG4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH12Q9NPG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH12Q9NPG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDH12Q9NPG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDH12Q9NPG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH12Q9NPG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms