Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEBOXQ9HB31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEBOXQ9HB31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEBOXQ9HB31 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEBOXQ9HB31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEBOXQ9HB31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEBOXQ9HB31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEBOXQ9HB31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEBOXQ9HB31 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEBOXQ9HB31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEBOXQ9HB31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEBOXQ9HB31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms