Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM16Q9HAZ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM16Q9HAZ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM16Q9HAZ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM16Q9HAZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM16Q9HAZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM16Q9HAZ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM16Q9HAZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM16Q9HAZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM16Q9HAZ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM16Q9HAZ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM16Q9HAZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM16Q9HAZ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM16Q9HAZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM16Q9HAZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms