Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4X1

RGCC, Regulator of cell cycle RGCC, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCCQ9H4X1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGCCQ9H4X1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGCCQ9H4X1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGCCQ9H4X1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGCCQ9H4X1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGCCQ9H4X1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGCCQ9H4X1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGCCQ9H4X1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms