Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRMDAQ9H2I8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRMDAQ9H2I8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRMDAQ9H2I8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRMDAQ9H2I8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRMDAQ9H2I8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRMDAQ9H2I8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRMDAQ9H2I8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRMDAQ9H2I8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRMDAQ9H2I8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms