Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BPESC1Q9GZL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPESC1Q9GZL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPESC1Q9GZL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPESC1Q9GZL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPESC1Q9GZL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPESC1Q9GZL8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPESC1Q9GZL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPESC1Q9GZL8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPESC1Q9GZL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPESC1Q9GZL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPESC1Q9GZL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms