Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
KDM5DQ9BY66 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5DQ9BY66 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
KDM5DQ9BY66 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
KDM5DQ9BY66 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
KDM5DQ9BY66 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM5DQ9BY66 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
KDM5DQ9BY66 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
KDM5DQ9BY66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
KDM5DQ9BY66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
KDM5DQ9BY66 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
KDM5DQ9BY66 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
KDM5DQ9BY66 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
KDM5DQ9BY66 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
KDM5DQ9BY66 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
KDM5DQ9BY66 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
KDM5DQ9BY66 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.84■■■■■ 4.13
KDM5DQ9BY66 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
KDM5DQ9BY66 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
KDM5DQ9BY66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
KDM5DQ9BY66 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM5DQ9BY66 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
KDM5DQ9BY66 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KDM5DQ9BY66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
KDM5DQ9BY66 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KDM5DQ9BY66 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KDM5DQ9BY66 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM5DQ9BY66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM5DQ9BY66 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM5DQ9BY66 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM5DQ9BY66 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM5DQ9BY66 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5DQ9BY66 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
KDM5DQ9BY66 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM5DQ9BY66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
KDM5DQ9BY66 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms