Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC1Q9BTT6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC1Q9BTT6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC1Q9BTT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC1Q9BTT6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC1Q9BTT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC1Q9BTT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC1Q9BTT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC1Q9BTT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC1Q9BTT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC1Q9BTT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC1Q9BTT6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC1Q9BTT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms