Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFJQ9BTM1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFJQ9BTM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFJQ9BTM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFJQ9BTM1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
H2AFJQ9BTM1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFJQ9BTM1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
H2AFJQ9BTM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2AFJQ9BTM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2AFJQ9BTM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFJQ9BTM1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFJQ9BTM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms