Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRACR2AQ9BSW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRACR2AQ9BSW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CRACR2AQ9BSW2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CRACR2AQ9BSW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRACR2AQ9BSW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CRACR2AQ9BSW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRACR2AQ9BSW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRACR2AQ9BSW2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CRACR2AQ9BSW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRACR2AQ9BSW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRACR2AQ9BSW2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CRACR2AQ9BSW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRACR2AQ9BSW2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRACR2AQ9BSW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRACR2AQ9BSW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRACR2AQ9BSW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRACR2AQ9BSW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRACR2AQ9BSW2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms