Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF559Q9BR84 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF559Q9BR84 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF559Q9BR84 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF559Q9BR84 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF559Q9BR84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF559Q9BR84 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF559Q9BR84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF559Q9BR84 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF559Q9BR84 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF559Q9BR84 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF559Q9BR84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF559Q9BR84 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF559Q9BR84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF559Q9BR84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF559Q9BR84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF559Q9BR84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF559Q9BR84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms