Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM1Q9BR11 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM1Q9BR11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM1Q9BR11 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM1Q9BR11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM1Q9BR11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSWIM1Q9BR11 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM1Q9BR11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZSWIM1Q9BR11 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZSWIM1Q9BR11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZSWIM1Q9BR11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM1Q9BR11 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZSWIM1Q9BR11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM1Q9BR11 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZSWIM1Q9BR11 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms