Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LITAFQ99732 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LITAFQ99732 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LITAFQ99732 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LITAFQ99732 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LITAFQ99732 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms