Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD5Q99717 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD5Q99717 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD5Q99717 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD5Q99717 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD5Q99717 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD5Q99717 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms