Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZFRQ96KR1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZFRQ96KR1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZFRQ96KR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZFRQ96KR1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZFRQ96KR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZFRQ96KR1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZFRQ96KR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZFRQ96KR1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZFRQ96KR1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZFRQ96KR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZFRQ96KR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZFRQ96KR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZFRQ96KR1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZFRQ96KR1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms