Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC34Q96HJ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC34Q96HJ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC34Q96HJ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC34Q96HJ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC34Q96HJ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC34Q96HJ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC34Q96HJ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC34Q96HJ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC34Q96HJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CCDC34Q96HJ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms