Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MISP3Q96FF7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MISP3Q96FF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MISP3Q96FF7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MISP3Q96FF7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MISP3Q96FF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MISP3Q96FF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms