Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJA3Q96EY1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJA3Q96EY1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJA3Q96EY1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJA3Q96EY1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA3Q96EY1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJA3Q96EY1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJA3Q96EY1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA3Q96EY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA3Q96EY1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA3Q96EY1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJA3Q96EY1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJA3Q96EY1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJA3Q96EY1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms