Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PABPC5Q96DU9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PABPC5Q96DU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PABPC5Q96DU9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PABPC5Q96DU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PABPC5Q96DU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PABPC5Q96DU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PABPC5Q96DU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PABPC5Q96DU9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PABPC5Q96DU9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms