Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHISA4Q96DD7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHISA4Q96DD7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHISA4Q96DD7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SHISA4Q96DD7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHISA4Q96DD7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHISA4Q96DD7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHISA4Q96DD7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHISA4Q96DD7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHISA4Q96DD7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHISA4Q96DD7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHISA4Q96DD7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHISA4Q96DD7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHISA4Q96DD7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms