Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD12Q96CX2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD12Q96CX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD12Q96CX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD12Q96CX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD12Q96CX2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCTD12Q96CX2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD12Q96CX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD12Q96CX2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCTD12Q96CX2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD12Q96CX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD12Q96CX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms