Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC59Q96AG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC59Q96AG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC59Q96AG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC59Q96AG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC59Q96AG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC59Q96AG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC59Q96AG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC59Q96AG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC59Q96AG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC59Q96AG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC59Q96AG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC59Q96AG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC59Q96AG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRC59Q96AG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC59Q96AG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRC59Q96AG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRRC59Q96AG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC59Q96AG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC59Q96AG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC59Q96AG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC59Q96AG4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRC59Q96AG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRC59Q96AG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRC59Q96AG4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC59Q96AG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC59Q96AG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRC59Q96AG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRC59Q96AG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms