Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MARVELD3Q96A59 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARVELD3Q96A59 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARVELD3Q96A59 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MARVELD3Q96A59 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARVELD3Q96A59 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARVELD3Q96A59 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARVELD3Q96A59 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms