Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPDL3BQ92485 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPDL3BQ92485 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPDL3BQ92485 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPDL3BQ92485 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPDL3BQ92485 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPDL3BQ92485 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPDL3BQ92485 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPDL3BQ92485 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3BQ92485 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPDL3BQ92485 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMPDL3BQ92485 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms