Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJA4Q8WW22 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJA4Q8WW22 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJA4Q8WW22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJA4Q8WW22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJA4Q8WW22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJA4Q8WW22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJA4Q8WW22 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJA4Q8WW22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms