Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C15orf40Q8WUR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C15orf40Q8WUR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C15orf40Q8WUR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C15orf40Q8WUR7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf40Q8WUR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf40Q8WUR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
C15orf40Q8WUR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf40Q8WUR7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf40Q8WUR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C15orf40Q8WUR7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C15orf40Q8WUR7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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