Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DTX3LQ8TDB6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DTX3LQ8TDB6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DTX3LQ8TDB6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DTX3LQ8TDB6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DTX3LQ8TDB6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DTX3LQ8TDB6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DTX3LQ8TDB6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DTX3LQ8TDB6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms