Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC18Q8N456 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC18Q8N456 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC18Q8N456 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC18Q8N456 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC18Q8N456 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC18Q8N456 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC18Q8N456 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC18Q8N456 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC18Q8N456 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC18Q8N456 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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