Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2J2Q8N2K1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2J2Q8N2K1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2J2Q8N2K1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2J2Q8N2K1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2J2Q8N2K1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2J2Q8N2K1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms