Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PROM2Q8N271 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PROM2Q8N271 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PROM2Q8N271 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PROM2Q8N271 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PROM2Q8N271 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PROM2Q8N271 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PROM2Q8N271 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PROM2Q8N271 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PROM2Q8N271 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PROM2Q8N271 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PROM2Q8N271 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PROM2Q8N271 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PROM2Q8N271 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PROM2Q8N271 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PROM2Q8N271 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PROM2Q8N271 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PROM2Q8N271 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PROM2Q8N271 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PROM2Q8N271 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PROM2Q8N271 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PROM2Q8N271 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PROM2Q8N271 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PROM2Q8N271 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PROM2Q8N271 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PROM2Q8N271 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PROM2Q8N271 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PROM2Q8N271 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PROM2Q8N271 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PROM2Q8N271 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms