Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM9

SLC38A6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6Q8IZM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A6Q8IZM9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A6Q8IZM9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A6Q8IZM9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC38A6Q8IZM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A6Q8IZM9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A6Q8IZM9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A6Q8IZM9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms