Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIBP1Q86W92 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIBP1Q86W92 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIBP1Q86W92 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPFIBP1Q86W92 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIBP1Q86W92 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIBP1Q86W92 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PPFIBP1Q86W92 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms