Protein–RNA interactions for Protein: Q86UU1

PHLDB1, Pleckstrin homology-like domain family B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB1Q86UU1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
PHLDB1Q86UU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PHLDB1Q86UU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PHLDB1Q86UU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PHLDB1Q86UU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PHLDB1Q86UU1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
PHLDB1Q86UU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PHLDB1Q86UU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PHLDB1Q86UU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PHLDB1Q86UU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PHLDB1Q86UU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PHLDB1Q86UU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PHLDB1Q86UU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PHLDB1Q86UU1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PHLDB1Q86UU1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
PHLDB1Q86UU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PHLDB1Q86UU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PHLDB1Q86UU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PHLDB1Q86UU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PHLDB1Q86UU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PHLDB1Q86UU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PHLDB1Q86UU1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PHLDB1Q86UU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
PHLDB1Q86UU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
PHLDB1Q86UU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PHLDB1Q86UU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PHLDB1Q86UU1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms