Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF39Q86UA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF39Q86UA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF39Q86UA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF39Q86UA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF39Q86UA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF39Q86UA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF39Q86UA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF39Q86UA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF39Q86UA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF39Q86UA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF39Q86UA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF39Q86UA1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF39Q86UA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms