Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBE2Q1Q7Z7E8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE2Q1Q7Z7E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE2Q1Q7Z7E8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE2Q1Q7Z7E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBE2Q1Q7Z7E8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBE2Q1Q7Z7E8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBE2Q1Q7Z7E8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE2Q1Q7Z7E8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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