Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP1Q7Z6B7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP1Q7Z6B7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP1Q7Z6B7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP1Q7Z6B7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRGAP1Q7Z6B7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRGAP1Q7Z6B7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP1Q7Z6B7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRGAP1Q7Z6B7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRGAP1Q7Z6B7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRGAP1Q7Z6B7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRGAP1Q7Z6B7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SRGAP1Q7Z6B7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP1Q7Z6B7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP1Q7Z6B7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms