Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z410

TMPRSS9, Transmembrane protease serine 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS9Q7Z410 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS9Q7Z410 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS9Q7Z410 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPRSS9Q7Z410 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS9Q7Z410 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS9Q7Z410 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS9Q7Z410 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS9Q7Z410 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS9Q7Z410 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS9Q7Z410 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS9Q7Z410 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS9Q7Z410 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms