Protein–RNA interactions for Protein: Q7L014

DDX46, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX46Q7L014 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX46Q7L014 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX46Q7L014 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDX46Q7L014 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX46Q7L014 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX46Q7L014 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX46Q7L014 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX46Q7L014 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DDX46Q7L014 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX46Q7L014 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX46Q7L014 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DDX46Q7L014 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DDX46Q7L014 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DDX46Q7L014 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DDX46Q7L014 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DDX46Q7L014 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX46Q7L014 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DDX46Q7L014 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX46Q7L014 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX46Q7L014 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX46Q7L014 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX46Q7L014 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
DDX46Q7L014 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DDX46Q7L014 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
DDX46Q7L014 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DDX46Q7L014 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX46Q7L014 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX46Q7L014 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DDX46Q7L014 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DDX46Q7L014 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDX46Q7L014 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDX46Q7L014 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms