Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SSH2Q76I76 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SSH2Q76I76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SSH2Q76I76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SSH2Q76I76 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SSH2Q76I76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SSH2Q76I76 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SSH2Q76I76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SSH2Q76I76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SSH2Q76I76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SSH2Q76I76 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SSH2Q76I76 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SSH2Q76I76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SSH2Q76I76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SSH2Q76I76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SSH2Q76I76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SSH2Q76I76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SSH2Q76I76 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SSH2Q76I76 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SSH2Q76I76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SSH2Q76I76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SSH2Q76I76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SSH2Q76I76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SSH2Q76I76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SSH2Q76I76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SSH2Q76I76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SSH2Q76I76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SSH2Q76I76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SSH2Q76I76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SSH2Q76I76 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SSH2Q76I76 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SSH2Q76I76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SSH2Q76I76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SSH2Q76I76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SSH2Q76I76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SSH2Q76I76 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms