Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAM43BQ6ZT52 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM43BQ6ZT52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM43BQ6ZT52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM43BQ6ZT52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM43BQ6ZT52 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM43BQ6ZT52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM43BQ6ZT52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM43BQ6ZT52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM43BQ6ZT52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM43BQ6ZT52 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM43BQ6ZT52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms