Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL4Q6ZR62 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTL4Q6ZR62 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTL4Q6ZR62 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL4Q6ZR62 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL4Q6ZR62 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL4Q6ZR62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTL4Q6ZR62 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms