Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPESP1Q6UW49 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPESP1Q6UW49 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPESP1Q6UW49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPESP1Q6UW49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPESP1Q6UW49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPESP1Q6UW49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPESP1Q6UW49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPESP1Q6UW49 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPESP1Q6UW49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPESP1Q6UW49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms