Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN13Q6MZZ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN13Q6MZZ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAPN13Q6MZZ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN13Q6MZZ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN13Q6MZZ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN13Q6MZZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN13Q6MZZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN13Q6MZZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms