Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0I6

KDM4D, Lysine-specific demethylase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4DQ6B0I6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM4DQ6B0I6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4DQ6B0I6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4DQ6B0I6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4DQ6B0I6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4DQ6B0I6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4DQ6B0I6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4DQ6B0I6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4DQ6B0I6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4DQ6B0I6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM4DQ6B0I6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4DQ6B0I6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4DQ6B0I6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4DQ6B0I6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4DQ6B0I6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4DQ6B0I6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4DQ6B0I6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms