Protein–RNA interactions for Protein: Q64LD2

WDR25, WD repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR25Q64LD2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR25Q64LD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR25Q64LD2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR25Q64LD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR25Q64LD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR25Q64LD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR25Q64LD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms