Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
C9orf84Q5VXU9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.95■■■■■ 4.31
C9orf84Q5VXU9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
C9orf84Q5VXU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
C9orf84Q5VXU9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
C9orf84Q5VXU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
C9orf84Q5VXU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.73■■■■■ 4.27
C9orf84Q5VXU9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
C9orf84Q5VXU9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
C9orf84Q5VXU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
C9orf84Q5VXU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
C9orf84Q5VXU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
C9orf84Q5VXU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
C9orf84Q5VXU9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
C9orf84Q5VXU9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
C9orf84Q5VXU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
C9orf84Q5VXU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
C9orf84Q5VXU9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
C9orf84Q5VXU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
C9orf84Q5VXU9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
C9orf84Q5VXU9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
C9orf84Q5VXU9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
C9orf84Q5VXU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.28■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
C9orf84Q5VXU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
C9orf84Q5VXU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
C9orf84Q5VXU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
C9orf84Q5VXU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
C9orf84Q5VXU9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
C9orf84Q5VXU9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
C9orf84Q5VXU9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms