Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QL3Q5VWW1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QL3Q5VWW1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QL3Q5VWW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QL3Q5VWW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QL3Q5VWW1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QL3Q5VWW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms