Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTC39BQ5VTQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC39BQ5VTQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC39BQ5VTQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC39BQ5VTQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC39BQ5VTQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC39BQ5VTQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC39BQ5VTQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC39BQ5VTQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC39BQ5VTQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39BQ5VTQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39BQ5VTQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC39BQ5VTQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC39BQ5VTQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39BQ5VTQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39BQ5VTQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39BQ5VTQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTC39BQ5VTQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39BQ5VTQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms